Localizado en una antigua casona colonial, edificada en 1818 por el Virrey, Joaquín de la Pezuela, para su descanso. En ella residió el Libertador San Martín y más tarde Simón Bolívar, por ello conocida como la Quinta de los Libertadores. Destacan la Estela de Raymondi y el Obelisco Tello, piezas líticas de la zona arqueológicas de Chavín de Huantar, que representan divinidades del periodo formativo (1400 a.C.), como también cerámicas de la cultura Mochica (100 – 700 d.C.), textiles de la cultura Paracas (1400 – 200 a.C) y objetos de metalurgia de las principales culturas del antiguo Perú, como Moche, Chimú e Inca, todo dispuesto de manera cronológica. También muestra una importante colección de Arte Colonial.